该中心专注推动天主教研究，其工作包括进行学术研究、制订相关大学课程、举办学术会议、编制学术出版和推广天主教文化。

基督教研究中心旨在推动及深化基督教传统研究，并在香港及中国的多元文化及宗教处境下，促进基督教与其他宗教传统的交流与对话。

文化研究中心于2014年成立，致力促进文化研究领域之学术研究发展。

优质生命教育中心致力与教会和教会学校合作，一同于学校推动生命教育，以理性和开放态度探讨人类的文化遗产和基督教传统。

该中心主要从事中国传统文化，尤其着重禅佛教文化的研究工作，包括主办国际学术研讨会、文化讲座及工作坊等活动，并会出版刊物，以及举行短期学人访问计划、中大学生佛教文化胜迹访问团等。

文化及宗教研究系于2006年与蓬瀛仙馆合作成立「道教文化研究中心」，旨在发展道教学术研究及推动普及道教文化教育。

中心于2015年由伊斯兰文化协会捐赠成立。中心旨在透过开展具国际地位的多学科研究项目，并参与宗教和文化的比较或对话研究，促进伊斯兰文化的学术研究，并加强公众对伊斯兰教的理解。

为回应基督教在内地急速发展，该中心特意于2021年改革暑期学术交流课程，为同学提供论文咨询，更有学术会议助学者与教师互相交流，丰富其学术经验。