該中心專注推動天主教研究，其工作包括進行學術研究、制訂相關大學課程、舉辦學術會議、編制學術出版和推廣天主教文化。

基督教研究中心旨在推動及深化基督教傳統研究，並在香港及中國的多元文化及宗教處境下，促進基督教與其他宗教傳統的交流與對話。

文化研究中心於2014年成立，致力促進文化研究領域之學術研究發展。

優質生命教育中心致力與教會和教會學校合作，一同於學校推動生命教育，以理性和開放態度探討人類的文化遺產和基督教傳統。

該中心主要從事中國傳統文化，尤其著重禪佛教文化的研究工作，包括主辦國際學術研討會、文化講座及工作坊等活動，並會出版刊物，以及舉行短期學人訪問計劃、中大學生佛教文化勝跡訪問團等。

文化及宗教研究系於2006年與蓬瀛仙館合作成立「道教文化研究中心」，旨在發展道教學術研究及推動普及道教文化教育。

中心於2015年由伊斯蘭文化協會捐贈成立。中心旨在透過開展具國際地位的多學科研究項目，並參與宗教和文化的比較或對話研究，促進伊斯蘭文化的學術研究，並加強公眾對伊斯蘭教的理解。

為回應基督教在內地急速發展，該中心特意於2021年改革暑期學術交流課程，為同學提供論文咨詢，更有學術會議助學者與教師互相交流，豐富其學術經驗。